MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 8780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016931	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016931	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016931	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016931	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016931	TA	3	6	1015	1020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016931	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016931	A	7	7	1049	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016931	T	6	6	1060	1065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016931	ATTT	2	8	1465	1472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016931	TAA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016931	CTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016931	T	7	7	6970	6976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016931	ATC	2	6	7112	7117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016931	AAG	2	6	7150	7155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016931	A	6	6	7159	7164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016931	GCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016931	T	6	6	7192	7197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016931	ATTG	2	8	7204	7211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016931	A	6	6	7385	7390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016931	TAGT	2	8	7451	7458	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016931	ATTG	2	8	7489	7496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016931	TTA	3	9	7520	7528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016931	TAT	2	6	7610	7615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016931	AT	3	6	7614	7619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016931	CTT	2	6	7624	7629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016931	GGA	2	6	7647	7652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016931	GGA	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016931	GCA	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016931	A	6	6	7690	7695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016931	AAG	2	6	7756	7761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016931	ATA	2	6	8276	8281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016931	ACA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016931	CTA	2	6	8379	8384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016931	A	6	6	8402	8407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016931	TAT	2	6	8440	8445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016931	TGC	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016931	TATGT	2	10	8572	8581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016931	TCT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016931	TCT	2	6	8690	8695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016931	TTAC	2	8	8798	8805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016931	AGC	2	6	8848	8853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016931	ATA	2	6	8876	8881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016931	TA	3	6	8893	8898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016931	AGT	2	6	11220	11225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016931	AT	3	6	11226	11231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016931	CTT	2	6	11233	11238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016931	AGT	2	6	11249	11254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016931	GAC	2	6	11272	11277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016931	ATTTA	2	10	11295	11304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016931	T	7	7	11305	11311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016931	ACT	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016931	TAT	2	6	12520	12525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016931	T	6	6	12537	12542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016931	ATT	2	6	12543	12548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016931	ATTTT	2	10	12556	12565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016931	AAT	2	6	12570	12575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016931	AGC	2	6	12638	12643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016931	ATA	2	6	12661	12666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016931	A	6	6	12666	12671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016931	TTAC	2	8	12689	12696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016931	TTAT	2	8	12737	12744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016931	TAT	2	6	15027	15032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016931	TAAT	2	8	15057	15064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016931	CT	3	6	15864	15869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016931	AAT	2	6	15896	15901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016931	A	6	6	16036	16041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016931	A	6	6	16069	16074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016931	T	6	6	16079	16084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016931	CAA	2	6	16146	16151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016931	CGT	2	6	16222	16227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016931	AT	4	8	16352	16359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016931	TAT	2	6	16364	16369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016931	CATT	2	8	16450	16457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016931	TCT	2	6	16467	16472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016931	TA	3	6	16846	16851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016931	ATT	2	6	16903	16908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016931	TAA	2	6	16939	16944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016931	TA	3	6	16945	16950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016931	ACC	2	6	17214	17219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016931	AAAT	2	8	17229	17236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016931	TAC	2	6	17247	17252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016931	TAA	2	6	19184	19189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016931	TAAA	2	8	19219	19226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016931	ACT	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016931	ATTT	2	8	19245	19252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016931	GTA	3	9	20755	20763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016931	TTG	2	6	20788	20793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016931	A	7	7	20833	20839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016931	CAAG	2	8	20922	20929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016931	ACA	2	6	20943	20948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016931	A	6	6	20973	20978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016931	CA	3	6	20980	20985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016931	GAT	2	6	20990	20995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016931	TAT	2	6	21522	21527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016931	AT	3	6	22211	22216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016931	CAA	2	6	22226	22231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016931	TAT	2	6	22283	22288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016931	ATT	3	9	22298	22306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016931	TAA	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016931	ATT	2	6	22358	22363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016931	ATT	2	6	22377	22382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016931	TGA	2	6	22393	22398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016931	AGA	2	6	22445	22450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016931	A	7	7	22450	22456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016931	A	7	7	22458	22464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016931	AGA	2	6	22493	22498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016931	T	7	7	22551	22557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016931	GCT	2	6	22563	22568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016931	TAT	2	6	22572	22577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016931	ATT	2	6	22582	22587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016931	TAA	2	6	22613	22618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016931	AATA	2	8	22620	22627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016931	TAA	2	6	22641	22646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016931	AG	3	6	22929	22934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016931	TTAGG	2	10	22938	22947	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016931	ATT	2	6	22961	22966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016931	CGTT	2	8	22972	22979	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016931	TAT	2	6	23017	23022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016931	TTA	2	6	23056	23061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016931	ATTA	2	8	23074	23081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016931	TA	3	6	23103	23108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016931	ATT	2	6	24331	24336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016931	AGAT	2	8	24343	24350	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016931	GTGTTG	2	12	24368	24379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016931	T	6	6	24472	24477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016931	AAC	2	6	24482	24487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016931	ATTT	2	8	25547	25554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016931	AAG	2	6	25568	25573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016931	T	6	6	25582	25587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016931	CTT	2	6	25598	25603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016931	TAG	2	6	25608	25613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016931	AT	3	6	25649	25654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016931	A	7	7	25655	25661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016931	TAA	2	6	26177	26182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016931	A	6	6	26181	26186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016931	T	6	6	26203	26208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016931	ATTGC	2	10	26252	26261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016931	T	6	6	26307	26312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016931	CAA	2	6	26321	26326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016931	TAG	2	6	26333	26338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016931	AAT	2	6	26356	26361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016931	A	6	6	26417	26422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016931	ATAA	2	8	29001	29008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016931	TAAT	2	8	29016	29023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016931	TA	3	6	29054	29059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016931	TTAA	2	8	29067	29074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016931	TCA	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016931	TTA	2	6	29158	29163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016931	AC	3	6	29184	29189	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_016931	A	6	6	29287	29292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016931	TTA	2	6	29370	29375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016931	A	6	6	29422	29427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016931	A	6	6	29467	29472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016931	A	6	6	29492	29497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016931	ATG	2	6	29529	29534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_016931	A	6	6	30323	30328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016931	AT	3	6	30415	30420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_016931	AGAAA	2	10	30736	30745	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_016931	A	6	6	30796	30801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_016931	T	6	6	31072	31077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_016931	CTT	2	6	37102	37107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_016931	A	6	6	37336	37341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_016931	TA	3	6	58583	58588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_016931	TA	3	6	58621	58626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_016931	TGA	2	6	58646	58651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_016931	TAT	3	9	58856	58864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_016931	T	6	6	59375	59380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_016931	TAA	2	6	59670	59675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_016931	ATT	2	6	59714	59719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_016931	TAA	2	6	59986	59991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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